MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 6074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013385	CAC	2	6	1294207	1294212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_013385	TCC	2	6	1294262	1294267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_013385	GCT	2	6	1294269	1294274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_013385	CCA	2	6	1294365	1294370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_013385	CCA	2	6	1294377	1294382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_013385	GAA	2	6	1294443	1294448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013385	AGA	2	6	1294478	1294483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_013385	TCC	2	6	1294586	1294591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_013385	TCC	2	6	1294616	1294621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_013385	C	6	6	1294645	1294650	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4011	NC_013385	AAAGG	2	10	1294748	1294757	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_013385	CTA	2	6	1294767	1294772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_013385	GAG	2	6	1294781	1294786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_013385	TGC	2	6	1294807	1294812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_013385	TCGGCC	2	12	1294820	1294831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_013385	CTCC	2	8	1294839	1294846	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4017	NC_013385	AGG	2	6	1294847	1294852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013385	CCCA	2	8	1294867	1294874	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4019	NC_013385	CCA	2	6	1294920	1294925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_013385	CCGC	2	8	1294926	1294933	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4021	NC_013385	CGG	2	6	1294947	1294952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_013385	GGCC	2	8	1295025	1295032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_013385	AAG	2	6	1295093	1295098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013385	GGAAAA	2	12	1295158	1295169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013385	CAGC	2	8	1295202	1295209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_013385	CAA	2	6	1295475	1295480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_013385	CTA	2	6	1295517	1295522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_013385	AGA	2	6	1295562	1295567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_013385	G	6	6	1295599	1295604	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_013385	CTT	2	6	1295620	1295625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_013385	GCC	2	6	1295655	1295660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_013385	GTA	2	6	1295716	1295721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_013385	CGAAG	2	10	1295734	1295743	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_013385	CTC	2	6	1295767	1295772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_013385	CTT	2	6	1295913	1295918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_013385	AAG	2	6	1295947	1295952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013385	CTA	2	6	1295973	1295978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_013385	CAA	2	6	1295992	1295997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_013385	ATA	2	6	1296031	1296036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_013385	TCC	3	9	1296986	1296994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_013385	TCT	2	6	1296999	1297004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_013385	CAC	2	6	1297801	1297806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_013385	CTTC	2	8	1297807	1297814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_013385	CTT	2	6	1298372	1298377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_013385	GAT	2	6	1298378	1298383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_013385	TTCCC	2	10	1299005	1299014	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4047	NC_013385	ATT	2	6	1299044	1299049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013385	AAGGA	2	10	1299119	1299128	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_013385	CTCCC	2	10	1301024	1301033	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4050	NC_013385	AGGG	2	8	1301059	1301066	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013385	TTA	2	6	1301528	1301533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_013385	AAC	2	6	1304066	1304071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_013385	TTC	2	6	1307740	1307745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_013385	GCG	2	6	1307783	1307788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_013385	GGC	2	6	1307791	1307796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_013385	CTT	2	6	1307839	1307844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_013385	GCC	2	6	1307861	1307866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_013385	GCT	2	6	1307882	1307887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_013385	GGCA	2	8	1307911	1307918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_013385	GCC	2	6	1307945	1307950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_013385	CCA	2	6	1308003	1308008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_013385	G	6	6	1308022	1308027	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_013385	G	6	6	1308066	1308071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013385	AAG	2	6	1308101	1308106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013385	GCAG	2	8	1308167	1308174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_013385	AGGCC	2	10	1308238	1308247	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4067	NC_013385	CCT	2	6	1308261	1308266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_013385	CA	3	6	1308269	1308274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_013385	CAC	2	6	1308281	1308286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_013385	TC	3	6	1308295	1308300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_013385	CAG	2	6	1308709	1308714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_013385	CCG	2	6	1308733	1308738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_013385	TAA	2	6	1308759	1308764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_013385	CTT	2	6	1308850	1308855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_013385	CAC	2	6	1308938	1308943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_013385	AGG	2	6	1308965	1308970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_013385	AGGT	2	8	1308983	1308990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_013385	AGA	2	6	1309035	1309040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_013385	CAC	2	6	1309052	1309057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_013385	CT	3	6	1309065	1309070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_013385	CTT	2	6	1309389	1309394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_013385	A	7	7	1309427	1309433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_013385	GCC	2	6	1309438	1309443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_013385	CCGC	2	8	1309453	1309460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4085	NC_013385	A	6	6	1309498	1309503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013385	GCG	2	6	1309511	1309516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_013385	CT	4	8	1309542	1309549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_013385	CAGC	2	8	1309553	1309560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_013385	T	6	6	1309581	1309586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_013385	ACAG	2	8	1309592	1309599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_013385	TTC	2	6	1309632	1309637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_013385	TTC	2	6	1312657	1312662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_013385	ATC	2	6	1312679	1312684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_013385	TGCT	2	8	1312697	1312704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_013385	T	6	6	1312706	1312711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_013385	A	6	6	1312748	1312753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_013385	T	7	7	1312756	1312762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013385	A	6	6	1312783	1312788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_013385	C	6	6	1314337	1314342	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4100	NC_013385	AG	3	6	1317931	1317936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013385	TTAACC	2	12	1317941	1317952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_013385	TCC	2	6	1318212	1318217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_013385	ACC	2	6	1319516	1319521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_013385	CGA	2	6	1319539	1319544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_013385	CTC	2	6	1324382	1324387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_013385	GAA	2	6	1324391	1324396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_013385	GGA	2	6	1325554	1325559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013385	AAG	2	6	1325560	1325565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_013385	CTT	2	6	1328037	1328042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_013385	AAG	2	6	1328045	1328050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_013385	TG	3	6	1328083	1328088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_013385	TGGAGG	2	12	1328105	1328116	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_013385	AGG	2	6	1329738	1329743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_013385	GCC	2	6	1330673	1330678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_013385	GGC	2	6	1330687	1330692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_013385	C	6	6	1332561	1332566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4117	NC_013385	TCC	3	9	1337382	1337390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_013385	CAGC	2	8	1337408	1337415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_013385	GAAG	2	8	1337422	1337429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_013385	TGA	2	6	1337449	1337454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_013385	CGG	2	6	1337463	1337468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_013385	CG	3	6	1338679	1338684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_013385	CGG	2	6	1338709	1338714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_013385	ATT	2	6	1338735	1338740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_013385	CCT	2	6	1338747	1338752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_013385	CTG	2	6	1338783	1338788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_013385	TCC	2	6	1338795	1338800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_013385	A	7	7	1338847	1338853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_013385	CGG	2	6	1338877	1338882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_013385	GAC	2	6	1338919	1338924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_013385	CAG	2	6	1338951	1338956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_013385	CG	3	6	1338991	1338996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4245	NC_013385	CCCTT	2	10	1348611	1348620	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4250	NC_013385	CAGG	2	8	1348714	1348721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4251	NC_013385	TCCC	2	8	1351601	1351608	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4252	NC_013385	CTC	2	6	1351642	1351647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4255	NC_013385	CGCGTC	2	12	1351732	1351743	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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4257	NC_013385	AGA	2	6	1351785	1351790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_013385	GCG	2	6	1351876	1351881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_013385	TCC	2	6	1351955	1351960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4260	NC_013385	TGA	2	6	1352021	1352026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_013385	GA	3	6	1352045	1352050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_013385	CG	3	6	1352069	1352074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4264	NC_013385	CTC	2	6	1352080	1352085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4265	NC_013385	CG	3	6	1352113	1352118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4266	NC_013385	GCA	2	6	1352160	1352165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4276	NC_013385	CCT	3	9	1352429	1352437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4280	NC_013385	TCG	2	6	1352575	1352580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4297	NC_013385	CGG	2	6	1353166	1353171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4305	NC_013385	GTCTAT	2	12	1353441	1353452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4306	NC_013385	CG	3	6	1353477	1353482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4372	NC_013385	CTGC	2	8	1355943	1355950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4375	NC_013385	TC	3	6	1356102	1356107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4376	NC_013385	CTTC	2	8	1356110	1356117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4377	NC_013385	TACC	2	8	1356130	1356137	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4378	NC_013385	CG	4	8	1356166	1356173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4379	NC_013385	TAGG	2	8	1356303	1356310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4381	NC_013385	CGG	2	6	1356377	1356382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4382	NC_013385	CTG	2	6	1356384	1356389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4383	NC_013385	GGA	2	6	1356452	1356457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4384	NC_013385	GCA	2	6	1356515	1356520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4385	NC_013385	AG	3	6	1356533	1356538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_013385	GTT	2	6	1356540	1356545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4387	NC_013385	GAA	2	6	1356597	1356602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4388	NC_013385	TCC	2	6	1356625	1356630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4389	NC_013385	CA	3	6	1356660	1356665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4390	NC_013385	A	6	6	1356680	1356685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_013385	GA	3	6	1356889	1356894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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